PBS Pro 사용 방법 정리(작성중)

1. 작업 제출 스크립트 작성

#!/bin/sh #PBS -V #PBS -q workq #PBS -N openmp_job #PBS -l select=1:ncpus=10:mpiprocs=1:ompthreads=10 #PBS -l walltime=04:00:00   cd $PBS_O_WORKDIR   ./a.out

- 파란색 부분을 적절히 수정해서 사용 합니다.

- 위 예제에서 붉은색 부분은 작업 제출 경로로 이동하게 하는 예제로 삭제하지 않고 사용 해야 실행 오류가 발생 하지 않습니다.

2. 작업 제출 방법

- "qsub {스크립트 명}" 으로 작업을 제출할 수 있습니다.

- 예제 : 스크립트 파일 이름이 openmp.sh 인 경우

$ qsub openmp.sh

3. 작업 조회

- qstat 명령으로 수행중인 작업과 종료된 작업을 조회

- -x 옵션을 사용할 경우 기존 작업 목록 조회 

$ qstat -x  Job id            Name             User              Time Use S Queue  ----------------  ---------------- ----------------  -------- - -----  0.mgmt            STDIN            applic            00:00:00 F workq  1.mgmt            STDIN            applic            00:00:00 F workq  2.mgmt            STDIN            applic            00:00:00 F workq  3.mgmt           STDIN            applic            00:00:00 F workq

4. 인터렉티브 작업 제출

- qsub 명령 뒤에 "-I(대문자 아이)" 옵션을 사용합니다.

- 자원 사용에 대한 설정은 "-l(소문자엘)"로 지정합니다.

$ qsub -I -V -l select=1:ncpus=10:mpiprocs=1:ompthreads=10 -l walltime=01:00:00

5. 작업 삭제

- "qdel {작업ID}" 로 제출된 작업을 삭제할 수 있습니다.

- 작업ID는 qstat 명령으로 조회 되는 "Job id" 항목의 값 입니다.

- 예제 : 작업ID 가 3.mgmt 인 경우

$ qdel 3.mgmt