2021. 8. 24. 11:06 나의일 관련/MSWindows
1. Microsoft Edge 실행
2. 설정
3. 기본 브라우저
4. "Internet Explorer를 사용하여 Microsoft Edge에서 사이트를 열어보세요" 에서 아래 두가지 중에 선택
- 호환되지 않는 사이트만(권장)
- 안 함
| excel 시간을 초로 변환 방법 기록 (0) | 2019.05.24 |
|---|---|
| FAT32 vs.exFAT 비교 (0) | 2017.12.01 |
| windows 종료 예약하기 (0) | 2017.10.30 |
| Windows sever 에서 자주 쓰는 명령 (0) | 2017.10.27 |
2020. 1. 28. 14:47 나의일 관련/클러스터관리툴
1. 작업 제출 스크립트 작성
#!/bin/sh #PBS -V #PBS -q workq #PBS -N openmp_job #PBS -l select=1:ncpus=10:mpiprocs=1:ompthreads=10 #PBS -l walltime=04:00:00
cd $PBS_O_WORKDIR ./a.out |
- 파란색 부분을 적절히 수정해서 사용 합니다.
- 위 예제에서 붉은색 부분은 작업 제출 경로로 이동하게 하는 예제로 삭제하지 않고 사용 해야 실행 오류가 발생 하지 않습니다.
2. 작업 제출 방법
- "qsub {스크립트 명}" 으로 작업을 제출할 수 있습니다.
- 예제 : 스크립트 파일 이름이 openmp.sh 인 경우
$ qsub openmp.sh |
3. 작업 조회
- qstat 명령으로 수행중인 작업과 종료된 작업을 조회
- -x 옵션을 사용할 경우 기존 작업 목록 조회
$ qstat -x Job id Name User Time Use S Queue ---------------- ---------------- ---------------- -------- - ----- 0.mgmt STDIN applic 00:00:00 F workq 1.mgmt STDIN applic 00:00:00 F workq 2.mgmt STDIN applic 00:00:00 F workq 3.mgmt STDIN applic 00:00:00 F workq |
4. 인터렉티브 작업 제출
- qsub 명령 뒤에 "-I(대문자 아이)" 옵션을 사용합니다.
- 자원 사용에 대한 설정은 "-l(소문자엘)"로 지정합니다.
$ qsub -I -V -l select=1:ncpus=10:mpiprocs=1:ompthreads=10 -l walltime=01:00:00 |
5. 작업 삭제
- "qdel {작업ID}" 로 제출된 작업을 삭제할 수 있습니다.
- 작업ID는 qstat 명령으로 조회 되는 "Job id" 항목의 값 입니다.
- 예제 : 작업ID 가 3.mgmt 인 경우
$ qdel 3.mgmt |
| ipmitool 명령어 모음 (1) | 2019.11.12 |
|---|---|
| 오류 내용 : ld: cannot find -lfl (0) | 2018.01.08 |
| linux 유용한 스크립트 기록 (0) | 2017.11.16 |
| PBS Pro stack size 조정 기록 (0) | 2017.11.13 |
| SLURM 공부 기록 (0) | 2017.11.08 |
2020. 1. 21. 10:51 나의일 관련/Linux
BiocManager 를 사용 하는 방법에 대하여 정리 합니다.
우선 wget 명령을 이용하여 "https://cran.r-project.org" 사이트에서 소스를 다운 받고,
R CMD INSTALL "패키지" 의 방법으로 BiocManager 를 설치합니다.
$ wget https://cran.r-project.org/src/contrib/BiocManager_1.30.10.tar.gz $ R CMD INSTALL BiocManager_1.30.10.tar.gz |
(1) 설치 된 BiocManager 버전 확인
$ R > BiocManager::version() [1] ‘3.10’ > |
(2) 사용할 수 있는 패키지 목록 조회
- BiocManager::available("패키지명")
- 아래는 "BSgenome.Hsapiens" 패키지 목록을 조회한 예제 입니다.
> BiocManager::available("BSgenome.Hsapiens") [1] "BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5" [2] "BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38" [3] "BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17" [4] "BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17.masked" [5] "BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18" [6] "BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked" [7] "BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19" [8] "BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked" [9] "BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38" [10] "BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked" > |
(3) 패키지 명 으로 설치 하는 방법
> BiocManager::install("stringr") |
(4) 패키지의 버전을 지정해서 설치하는 방법
> BiocManager::install("stringr", version = "3.8") |
- 참고 : https://cran.r-project.org/web/packages/BiocManager/vignettes/BiocManager.html
| CentOS 7.5 grub2 수정 (0) | 2019.12.16 |
|---|---|
| QT-4.8.6 빌드 오류 해결 내용 정리 (0) | 2019.12.09 |
| binutils 관련 오류 기록 (0) | 2019.12.02 |
| nmon gpu 수정 버전 (0) | 2019.11.14 |
| medaka 와 기타 패키지 설치 기록 (0) | 2019.11.06 |
