2017. 12. 1. 16:49 나의일 관련/MSWindows

FAT32 vs.exFAT 비교

FAT32 와 exFAT 파일 시스템 비교 


물어보는 사람이 있어서 찾아 보고 정리.


 구분

FAT32

exFAT 

비고 

 Max. Volume Size

8TB 

128 PB 

 

 Max. File Size

4 GB 

16 EB 

 

 Max. File Name Length

255 

255 

 


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Posted by 천연사이다

2017. 11. 16. 17:33 나의일 관련/클러스터관리툴

linux 유용한 스크립트 기록

linux 에서 사용하는 유용한 스크립트 정리

 

- PATH 환경변수에 설정한 경로 출력 

 $ echo $PATH | tr ":" "\n" | grep "\/"


- LD_LIBRARY_PATH 환경변수에 설정한 경로 출력

 $ echo $LD_LIBRARY_PATH | tr ":" "\n" | grep "\/"


- SGE 작업 제출 스크립트 에서 실행 hostname list 얻기 스크립트

 host=`cat $TMPDIR/machines | uniq | tr "\n" "," | sed "s/,$/\n/g"`


- Linux 시스템 기본 정보 확인하기

[예제]

#!/bin/sh


if [ -f /etc/redhat-release ]; then 

    version=`cat /etc/redhat-release | tr -d ['a-z','A-Z','\(','\)'," "]`

    glibc_version=`ldd --version | head -n 1 | tr -d ['a-z','A-Z','\(','\)'," "]`

    gcc_path=`which gcc`

    default_gccversion=`$gcc_path --version | head -n 1 | awk '{print $1" "$3}'`

    echo "OS Version : RedHat Series" $version

    echo "System Compiler Version :" $default_gccversion

    echo "GNU libc Version :" $glibc_version

fi 

[결과]

OS Version : RedHat Series 5.3

System Compiler Version : gcc 4.1.2

GNU libc Version : 2.5 



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2017. 11. 13. 14:33 나의일 관련/Linux

OpenFOAM 3.0.0 설치 기록

OpenFOAM 3.0.0 source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다.


1. 설치 환경

 구분

내용 

 OS

RHEL 5.3 

 기타

intel-2015 컴파일러 사용

openmpi-2.1.1 MPI 사용

python-2.7.12 사용.


2. 환경 설정 방법

[ 환경 설정 ]

 $ module load compiler/intel-2015 mpi/openmpi-2.1.1 applic/python-2.7.12


3. 설치

 설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고, 소스 파일 다운로드 등은 생략한다. 
- 참고 : https://proteusmaster.urcf.drexel.edu/urcfwiki/index.php/Compiling_OpenFOAM 

  설치과정

$ mkdir OpenFOAM

$ cd OpenFOAM

$ tar xvf OpenFOAM-3.0.0.tgz 

$ tar xvf ThirdParty-3.0.0.tgz

$ export WM_CC=icc

$ export WM_CXX=icpc

$ export WM_CFLAGS="-m64 -fPIC -O3 -fopenmp"

$ export WM_CFLAGS="-m64 -fPIC -O3 -fopenmp"

$ export WM_COMPILER_ARCH=IccDPInt32Opt

$ export WM_NCOMPPROCS=8

$ cd OpenFOAM-3.0.0

$ vi etc/bashrc

 - - - 수정은 아래 (1) 참조 - - -

$ vi etc/config/CGAL.sh

 - - - 수정은 아래 (2) 참조 - - -

$ source etc/bashrc

$ vi $WM_DIR/rules/linux64Icc/cOpt

$ vi $WM_DIR/rules/linux64Icc/c++Opt

$ cd $WM_DIR

$ ./makeWmake

$ cd $WM_THIRD_PARTY_DIR

$ 

$ tar xvjf gmp-6.1.0.tar.bz2    # GMP-6.1.0 버전 설치

cd gmp-6.1.0

$ ./configure --prefix=$WM_THIRD_PARTY_DIR/platforms/${WM_ARCH}${WM_COMPILER}/gmp-6.1.0 \

--enable-cxx CC=icc CXX=icpc CFLAGS="-O3 -fPIC" CXXFLAGS="-O3 -fPIC" 

$ make

$ make install

$

$ tar xvzf mpfr-3.1.3.tar.gz   # MPFR-3.1.3 버전 설치

$ cd mpfr-3.1.3

$ ./configure --prefix=$WM_THIRD_PARTY_DIR/platforms/${WM_ARCH}${WM_COMPILER}/mpfr-3.1.3 \

CC=icc CXX=icpc CFLAGS="-O3 -fPIC" CXXFLAGS="-O3 -fPIC" --disable-thread-safe \

--with-gmp=$WM_THIRD_PARTY_DIR/platforms/${WM_ARCH}${WM_COMPILER}/gmp-6.1.0 

$ make

$ make install

$ 
$ tar xvzf boost_1_61_0.tar.gz   #BOOST-1.61.0 버전 설치
$ cd boost_1_61_0
$ ./bootstrap.sh --prefix=$WM_THIRD_PARTY_DIR/platforms/${WM_ARCH}${WM_COMPILER}/boost_1_61_0
$ ./b2 install --prefix=$WM_THIRD_PARTY_DIR/platforms/${WM_ARCH}${WM_COMPILER}/boost_1_61_0
$ export WM_COMPILER_ARCH=Icc
$
$ vi makeCGAL
- - - 수정은 아래 (3) 참조 - - -
$ vi ${WM_THIRD_PARTY_DIR}/etc/wmakeFiles/scotch/Makefile.inc.i686_pc_linux2.shlib-OpenFOAM-64Int32
- - - 수정은 아래 (4) 참조 - - -
$ ./makeCGAL boost_1_61_0 gmp-6.1.0 mpfr-3.1.3
$ export SCOTCH_VERSION=6
$ ./Allwmake
$ cd $WM_PROJECT_DIR
$ ./Allwmake

(1) etc/bashrc 파일 수정
 intel 컴파일러에 맞게 수정
[변경 전]

foamInstall=$HOME/$WM_PROJECT

export WM_COMPILER=Gcc

[변경 후]

foamInstall=$USER/applications/$WM_PROJECT

export WM_COMPILER=Icc


(2) etc/config/CGAL.sh 파일 수정

[변경 전]

boost_version=boost-system

[변경 후]

boost_version=boost_1_61_0


(3) makeCGAL 파일 수정

패키지들 버전에 맞게 수정

cgalPACKAGE=CGAL-4.7

boostPACKAGE=boost_1_61_0

gmpPACKAGE=gmp-6.1.0

mpfrPACKAGE=mpfr-3.1.3 


(4) Makefile.inc.i686_pc_linux2.shlib-OpenFOAM-64Int32 파일 수정

intel 컴파일러 환경으로 수정

[변경 전]

AR      = gcc

CCS     = gcc

[변경 후]

AR      = icc

CCS     = icc


4. 사용 환경 설정

$ module load compiler/intel-2015 mpi/openmpi-2.1.1 

$ source /applic/applications/OpenFOAM/OpenFOAM-3.0.0/etc/bashrc







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2017. 11. 13. 10:15 나의일 관련/클러스터관리툴

PBS Pro stack size 조정 기록

PBS Pro 에서 stack size 를 unlimited 로 변경할때.


- 대상 파일 : /opr/pbs/13.1.1.162303/lib/init.d/limits.pbs_mon

- 수정 방법 : 아래 예제와 같이 "ulimit -s unlimited" 를 조건문 밖에 작성.


#       This file will be sourced by the PBS startup script, pbs_init.d.

#       It is here only for binary compatibility with previous releases.

#       Feel free to replace its contents.

if [ -f /etc/sgi-release -o -f /etc/sgi-compute-node-release ] ; then

    MEMLOCKLIM=`ulimit -l`

    NOFILESLIM=`ulimit -n`

    STACKLIM=`ulimit -s`

    ulimit -l unlimited

    ulimit -n 16384

    ulimit -s unlimited

fi


    ulimit -s unlimited




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2017. 11. 8. 10:14 나의일 관련/클러스터관리툴

SLURM 공부 기록


[slurm 계산 노드 정보 ]

- parririon 정보 확인

$ sinfo 

- 상세 자원 정보 출력

$ sinfo -N -l

- sinfo 사용 참고 : https://slurm.schedmd.com/sinfo.html


[작업 제출]

sbatch 명령을 이용하여 slurm 스케줄러로 작업 제출

 $ sbatch run.sh 


[작업 조회]

squeue 명령을 이용하여 작업 조회

  $ squeue

* R : RUNNING 상태

* PD : PENDING 상태

* S : SUSPENDED 상태

* ST : STOP 상태

* CD : COMPLETED 상태

* CA : CANCELLED 상태

* F : FAILED 상태

* NF : NODE_FAIL 상태

- 참고 : https://slurm.schedmd.com/squeue.html


[작업 정보 조회]

sacct -j {작업ID} --format {포멧지정}

sacct -j 1902 --format JobID,jobname,NTasks,nodelist,MaxRSS,MaxVMSize,AveRSS,AveVMSize


[수행 중인 작업 정보 조회]

sstat -j {작업ID} --format {포멧지정}

sstat -j 1902 --format JobID,jobname,nodelist,MaxVMSize,MaxRSS,MaxDiskRead,MaxDiskWrite


 $ scontrol show job 1902


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2017. 11. 2. 10:19 나의일 관련/클러스터관리툴

PBS Pro 사용자의 작업 제출 허용 기록


PBS Pro 에서 사용자의 작업 제출 허용 시키지 

PBS Manager 서버에서 qmgr 명령으로 변경

qmgr -c "set server flatted = true"

또는

# qmgr

Max open servers: 49

Qmgr: s s flatuid=true 





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2017. 10. 31. 10:22 나의일 관련/Linux

CUDA SDK 8.0 관련 이슈 기록

CUDA SDK 8.0 버전이 icc 17.0 버전 이상을 인식하지 못하는 문제가 있어 수정 기록

- 수정 파일 : /usr/local/cuda-8.0/include/host_config.h (기본 CUDA SDK 설치 경로를 사용한 경우)

- 참고 : http://archive.ambermd.org/201707/0114.html

[수정 전]

 #if (__ICC != 1500 && __ICC != 1600) || !defined(__GNUC__) || 

!defined(__LP64__) 

[수정 후]

#if (__ICC != 1600 && __ICC != 1700) || !defined(__GNUC__) || 

!defined(__LP64__) 


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2017. 10. 30. 12:52 나의일 관련/MSWindows

windows 종료 예약하기

windows 종료 예약할때

 

실행 창에서 shutdown 명령을 이용하여 -t 옵션으로 초단위로 시간 지정하여 끄기

 

[5분후 종료 예제]

shutdown -s -t 300 


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2017. 10. 27. 16:29 나의일 관련/클러스터관리툴

redhat 계열 repo 파일 생성

/etc/yum.repos.d 경로에 파일명.repo 와 같이 repo 확장자로 파일 생성

 

[local]

name=local packages

baseurl=file:///mnt

enabled=1

gpgcheck=0


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2017. 10. 27. 16:12 나의일 관련/Linux

MPI hello world 예제(Fortran언어)

시스템 상태 체크 시 사용하는 MPI 코드


       program main

      use mpi

      implicit none


      integer :: provided, ierr, size, rank, len

      character (len=MPI_MAX_PROCESSOR_NAME) :: name

      call MPI_Init_thread(MPI_THREAD_MULTIPLE, provided, ierr)


      call MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, rank, ierr)

      call MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, size, ierr)

      call MPI_Get_processor_name(name, len, ierr)


      write(*, '(2A,I2,A,I2,3A)') &

           'Hello, World! ', &

           'I am process ', rank, &

           ' of ', size, &

           ' on ', name(1:len), '.'


      call MPI_Finalize(ierr)

      end program main


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